為軍方研究生化武器的安布雷拉公司在浣熊市地下設有巨大的研究中心——蜂巢，由于一次意外事故導致可通過空氣傳播的生化武器泄露，負責蜂巢安保的電腦系統“紅色女王”啟動應急措施，卻導致數百名工作人員罹難……四小時后，蜂巢安保人員愛麗絲（米拉·喬沃維奇 Milla Jovovich 飾）在蜂巢出口醒來，并且因為催眠氣體而失憶。一支受命關閉紅色女王的特種小隊來到此處，與愛麗絲、自稱警察的安德森，以及蜂巢工作人員帕克斯組隊深入地下。一行人因任務目標與紅色女王沖突而先后遭遇保衛系統和喪尸的連番襲擊，而愛麗絲漸漸恢復,展現扣人心弦的戲碼。